桑椹发酵酒污染菌的分离纯化鉴定及控制方法研究(3)
(4)纯化产物柱式胶回收:割下含目的DNA片断的琼脂糖凝胶,放入1.5mL离心管中,称重。按每100mg琼脂糖加入600 μLS1液,55℃水浴10min,完全溶解。加入1/3S1体积的异丙醇,混匀。55℃水浴10min,将融化后的凝胶移入吸附柱,9000×g离心1min。倒掉收集管中的液体,将吸附柱放入同一个收集管中。
在吸附柱中加入450μL的W1液,静置1min后,9000×g离心15s。倒掉收集管中的液体,将吸附柱放入同一个收集管中,再在吸附柱中加入450μL的W1液,静置1min后,9000×g离心15s。倒掉收集管中的液体,将吸附柱放入同一个收集管中,9000×g离心1min。将吸附柱放入新的1.5mL离心管中,在吸附膜中加入30μL的T1液,室温静置5min,9000×g离心2min,将DNA保存于-20℃备用。
(5)与pUCm-T载体连接:连接体系为10μL。在微型离心管中加入以下成分:pMD18-T Vector 0.5μL,DNA模板4.5μL,5μL的Ligation SolutionⅠ,16℃连接过夜。
(6)转化:采用CaCl2法预先大量制备E.coli JM109的感受态细胞,取出一支100μL已制备好的保存在-70℃超低温冰箱中的感受态大肠杆菌,放在冰上加入DNA连接液10μL,冰上放置30min。然后42℃,90s。0℃,2min。加入LB液体培养基400μL,放置在37℃摇床上,150r/min,45min,将离心管中的液体全部涂布在含Amp、IPTG、X-Gal(浓度均为100mg/mL)的LB固体平板上,37℃培养过夜。
(7)挑菌、扩增:观察培养皿上的转化子生长状况,在超净台上用接种针从每个培养皿上挑取3个白色克隆子,放入含有Amp的2mL LB液体培养基的小试管中,37℃,180r/min摇床上培养8h。
(8)质粒抽提:将培养好的细菌全部倒入2mL的离心管中,9000×g离心1min。弃上清,在细菌沉淀中加入250μL的P1液,立刻彻底振荡悬浮。加入250μL的P2液,立刻温和上下颠倒离心管5次—10次,混匀,室温静置4min,加入350μL的P3液,立刻温和上下颠倒离心管5次—10次混匀。12000×g离心15min。将上清液小心地移入吸附柱,9000×g离心15s,倒掉收集管中的液体,将吸附柱移入同一个收集管。在吸附柱中加入400μL的B1液,9000×g离心15s。再在吸附柱中加入300μL的W1液,9000×g离心15s。倒掉收集管中的液体,将吸附柱移入同一个收集管中。在吸附柱中加入600μL的W1液,静置1min后,9000×g离心15s。倒掉收集管中的液体,将吸附柱移入同一个收集管。9000×g离心1min。将吸附柱放入一个新的1.5mL的离心管中。在吸附膜中央加入50μL的T1液,室温静置5min,9000×g离心1min。将提好的质粒放在-20℃保存备用。
(9)PCR法鉴定插入片断:以抽提的质粒为模板,用PCR法鉴定质粒中是否有插入片断,条件参照(2)。
(10)序列测定和同源性分析:将含插入片断的质粒,送宝生物工程(大连)有限公司进行序列测定。测序结果经DNAMAN3.0软件去载体后,将序列提交GenBank数据库,利用Blastn软件进行序列比对。
2.研究结果
对两批次六份样品:第一批的42#(灭过菌的样品)、88#(未灭菌样品)和第二批的33#、42#、88#、107#分别用细菌培养基和真菌培养基进行平板分离培养检测,分离获得其中的污染微生物纯种并检测污染程度。
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编辑:张怡
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